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整体解决方案:应对新冠突变株全方位研究新冠突变体试剂库

时间:2022-03-08 14:57:47 浏览次数:

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整体解决方案:应对新冠突变株全方位研究新冠突变体试剂库

整体解决方案:应对新冠突变株全方位研究的新冠突变体试剂库新冠病毒造成的大流行正在对全球人类健康造成巨大损害。新冠病毒属于RNA病毒,比DNA病毒更容易发生突变。近期出现的新冠突变株主要有两个方面引人深思:其一是刺突蛋白(S),尤其是关键受体结合域(RBD),出现突变或者突变累积现象,可能加强新冠病毒刺突蛋白与受体ACE2的结合能力,增加病毒的传播力或致病性;其二是突变可能会改变抗原的关键表位,使已筛选的中和抗体亲和力下降,发生免疫逃逸,降低疫苗和中和抗体的保护效果。

英国B.1.1.7突变株

首次在英国发现,研究表明其传播力增加了30%以上。Davies等人对来自英国3个地区的数据进行建模,估计该突变株比以往突变株的传播力高56%。其Spike上的特征突变有10个,NP的特征突变有2个。由于Spike蛋白是疫苗开发及治疗性抗体开发的主要靶点,所以这些突变是否会产生抗体逃逸,降低疫苗和抗体药物的效力成为科学家们关注的焦点。

研究表明,接种辉瑞/BioNTech和Moderna mRNA疫苗的血清对带有B.1.1.7的假病毒的中和能力与非突变相比无显著差异。阿斯利康的腺病毒载体新冠疫苗对B.1.1.7的保护效力与其他在英国流行的毒株无差异。Novavax重组蛋白疫苗的三期临床数据显示,对新冠病毒的保护效力为90%,而对B.1.1.7突变的保护效力为85%。以上研究结果提示,这些疫苗对B.1.1.7突变株的保护效力可能不变。

南非B.1.351突变株

研究表明其传播力增加了约50%,但还没有证据证明其致病性增加。其RBD区域存在E484K,被认为是中和抗体中和活性降低的主要原因。接种辉瑞/BioNTech和Moderna mRNA 疫苗后的血清对B.1.351的假病毒中和作用下降,Moderna的数据显示中和作用下降了6倍。而Novavax重组蛋白疫苗三期临床试验结果显示,对B.1.351的有效性低于50%。

巴西P.1突变株

已在日本、美国、巴西、德国传播,没有证据表明其传播力和致病性增加。在RBD区域存在K417T、E484K、N501Y三个特征突变。由于其RBD区域存在E484K位点,所以科学家担心其可能存在免疫逃逸。

加州B.1.429突变株

又称为CAL.20C,Cedars-Sinai医学中心的研究人员于2020年7月在加利福尼亚首次观察到。近期出现在美国以外的其他国家,如澳大利亚。此突变株可能更具传播力,数据显示其占据了大部分加州分离出的病例。其特征突变包含L452R,研究发现此位点突变会降低对

中和抗体的敏感性。有关此突变还需更多研究。

目前,义翘神州已开发出一系列针对突变株的蛋白、抗体、假病毒、基因等相关产品,形成了新冠突变株研究产品库,为新冠病毒研究、防治及诊断提供优质的产品及支持。

其主要应用如下:

应用1:检测突变蛋白与ACE2结合力,可用于突变株主要特征及传播力的研究

义翘神州已开发出多种重组新冠突变体蛋白。经ELISA验证,重组RBD N501Y突变(Cat: 40592-V08H82)以及重组RBD K417N、E484K、N501Y多位点突变(Cat: 40592-V08H85)对ACE2的结合能力更强于新冠野生型毒株RBD蛋白(Cat: 40592-V08H)。

以上数据结果与Charlie Laffeber等人的研究结果类似,他们通过SPR实验验证重组RBD 蛋白和RBD突变体对ACE2结合活性的影响。结果显示,英国突变株主要突变体蛋白N501Y 与ACE2的结合力增加近9倍,而南非突变株主要突变体蛋白K417N、E484K、N501Y与ACE2的结合力增加近3倍。

应用2:检测突变蛋白对中和抗体效力的影响

为验证新冠突变体对中和抗体中和效应的影响,我们通过竞争ELISA法验证中和抗体(义翘神州自主研发)对重组RBD突变位点N501Y(英国突变株B.1.1.7重要突变位点,

40592-V08H82)以及重组RBD 突变位点K417N、E484K、N501Y(南非突变株B.1.351重要突变位点,40592-V08H85)的中和效力。结果发现,中和抗体对南非突变株的主要突变位

点的中和效应存在一定的差异。并且有7株抗体对新冠突变蛋白有中和作用。

目前已有研究发现,新冠突变株存在抗体逃逸现象,已获批或正在开发的抗体药对新冠病毒的疗效将存在不确定性。义翘神州目前已开发了大部分重要突变位点的重组突变体蛋白,可助力广谱中和抗体以及新冠抗体药物开发。

中和抗体WT RBD蛋白N501Y突变蛋白K417N、E484K、N501Y突变蛋白40150-D001 245.5 466.9 404.5

40150-D002 253.4 769.2 484.6

40591-MM43 146.6 274.9 228.2

40592-MM57 475.4 934.2 -

40592-R001 66.5 115.3 -

40592-R118 20.4 97.8 -

40592-R117 21.8 93.5 -

注:WT: Wild Type;以上表格中数值为IC50(ng/mL)

应用3:验证新冠抗原检测试剂对突变蛋白的识别

抗原检测相对新冠其他检测方法具有操作简便、快捷、无需专业人员和特殊空间、设备

等优点。目前,美国FDA共紧急授权14款新冠抗原检测产品,而国内NMPA也批准万孚、

万泰等公司的抗原检测试剂盒上市。

抗原检测试剂盒主要以N蛋白做为检测标志物,检测灵敏度高,应用最广,针对RBD

区域的抗原检测试剂盒相对较少。新冠病毒在不断的变异过程中,N蛋白也出现了某些频率

较高的突变。

义翘神州密切关注新冠突变株的研究动态,快速开发生产重要突位点相应的重组蛋白以及相关的抗体试剂,为诊断开发企业提供专业支持。经ELISA验证,义翘神州开发的N抗体可以识别高频突变重组N蛋白。

•数据来源于GISAID

•GISAID促进快速共享导致COVID-19的所有冠状病毒的数据

•NP(R203K,G204R)是NP蛋白的上出现的高频突变,参考文献来源https://http://www.wendangku.net/doc/7e41972683c758f5f61fb7360b4c2e3f56272530.html /10.3389/fmicb.2020.01800 •NP(P13L), NP(S194L), NP(I292T)是NP蛋白的上出现的高频突变,参考文献来源于

https://http://www.wendangku.net/doc/7e41972683c758f5f61fb7360b4c2e3f56272530.html /10.1002/jmv.26626

•毒株信息:UK variant (lineage B.1.1.7), South Africa variant (lineage B.1.351), Brazil variant (lineage P.1) 应用4:评估新冠疫苗对突变株的保护效力

新冠突变株对已上市或临床研究阶段的疫苗有哪些影响,是目前广泛关注的问题。针对该问题,FDA发布了新冠突变疫苗开发指南,同时部分企业也开始布局针对突变株疫苗的开发规划。假病毒作为疫苗效应验证的重要工具,被广泛使用。义翘神州开发了新冠突变体假病毒(PSV001,PSV005),可助力疫苗效应评估。

参考文献:

1.https://http://www.wendangku.net/doc/7e41972683c758f5f61fb7360b4c2e3f56272530.html /10.1101/2021.0

2.06.21251159

2. https://http://www.wendangku.net/doc/7e41972683c758f5f61fb7360b4c2e3f56272530.html /10.1101/2020.12.24.20248822

3.https://http://www.wendangku.net/doc/7e41972683c758f5f61fb7360b4c2e3f56272530.html /10.1101/2021.02.22.432357

4.https://http://www.wendangku.net/doc/7e41972683c758f5f61fb7360b4c2e3f56272530.html /content/10.1101/2020.11.30.405472v1

5.https://http://www.wendangku.net/doc/7e41972683c758f5f61fb7360b4c2e3f56272530.html /10.1101/2021.02.18.431897

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